En esta versión de Pokémon, no tendrás que atrapar a todos los Pokémon para llegar a convertirte en el mejor entrenador del mundo, sino que ahora será distinto. En esta ocasión, formas parte de una organización llamada Pokémon Ranger que piensa que las extrañas criaturas pueden convivir con los seres humanos y ayudarse mutuamente para superar las barreras de la vida. En Pokémon Ranger te embarcarás en una aventura completamente nueva, en la que tendrás que cumplir una serie de misiones para convertirte en el mejor Ranger de Floresta.


Antes de comenzar la aventura tendrás que elegir si eres chico o chica. Dependiendo de la opción elegida, contarás con un pokemon acompañante diferente. Si eliges chico, tu acompañante será Minun, pero si al contrario eliges ser chica, tu pokemon acompañante será un Plusle.


En Pokémon Ranger, los rangers no necesitan hacer uso de las Pokeball para capturar a los Pokemon, y luego combatir con ellos ya que sólo los usarán en situaciones puntuales para superar algunos obstáculos. Por ello, el método de captura es totalmente diferente a lo visto con anterioridad. El nuevo accesorio está compuesto por dos elementos. En primer lugar, tenemos el "Capturador" que es una especie de peonza con la que atraparemos a los Pokémon. En segundo lugar, está el "Capture Stylus", instrumento que usaremos para dirigir el movimiento de la peonza y encerrar a los Pokémon. Por ello, la captura de los Pokémon la realizaremos íntegramente utilizando la pantalla táctil. El funcionamiento del nuevo sistema es simple e intuitivo permitiendo al jugador hacerse con una criatura con unos cuantos movimientos sobre la pantalla táctil. Cuando encuentras a un Pokémon, en la pantalla táctil aparecerá la criatura y tendrás que ir rodeándole dibujando círculos hasta que se debilite y sea capturado.


Como Ranger tendrás que superar todo tipo de obstáculos y adversarios. El juego contiene misiones de todo tipo en las que tendrás que defender a los Pokémon, rescatar a la mascota extraviada de un chico más bien descuidado y como no, acabar con los malos. En esta ocasión, el papel de malo recae sobre el Equipo Go-Rock.


Otra gran ausencia en esta edición son las medallas. En este juego no tendrás que ir gimnasio por gimnasio venciendo a los líderes Pokémon para obtener sus medallas. Ahora, cada vez que cumplas una misión con éxito recibirás estrellas y puntos de experiencia para tu artilugio de captura (Capturador). La región de Floresta está repleta de obstáculos que te impedirán el paso en numerosas ocasiones. Para acabar con ellos, usarás las habilidades especiales de cada uno de tus Pokémon. Por ejemplo, si en tu caminar encuentras una zona bloqueada por que te impide el paso tendrás que utilizar a un Pokémon elemental que acabe con el obstáculo. Finalmente, no hay que olvidar la Pokédex, elemento que no se ha eliminado en esta edición del juego. En esta ocasión, cada Pokémon que captures quedará registrado pudiendo visualizar todas sus características.